Vik adındaki oduncu ve iki ayı kardeş ortaya çıkmış olan bir icat yüzünden olduklarından çok daha küçük boyutlara gelmişlerdir. Ayı kardeşler uzun zamandır üzerinde çalışmakta oldukları icadı kendi üzerlerinde denemişlerdir ancak sonuç onlar için hoş olmamıştır. Ayı Kardeşler: Eyvah Ayılar Küçüldü!da önceden büyük ve görkemli bir görünüme sahip olan ayılar artık miniciktir ve bu boyla hayatlarını sürdürmenin ne kadar zor olduğunu keşfedeceklerdir. Çevre kirliliğinden büyük ölçüde etkilenmiş olan kardeşler bir yandan farkındalık kazanırken diğer bir yandan da eski hallerine dönmenin bir yolunu bulmaya çalışmaktadırlar. Pek çok ilginç olay ile karşılaşmış olan ayı kardeşler bu macerada istediklerine ulaşabilecekler midir?